Я проверяю свой ноутбук AISом,сканерами:MBAM,Dr.WebCureIt!,msert от Windowsa-http://www.microsoft.com/security/scanner/ru-ru/default.aspx антируткит TDSSKiller-http://support.kaspersky.com/faq?qid=208283363.Время занимает в среднем от 2 часов до 35 минут.Каждая программа по своему(скорость)проверяет,да и количество проверенных папок и файлов у всех разное.