1. В карантин помещаются файлы, опознанные антивирусом как опасные. В карантине avast! не лечит. Вы можете либо удалить файлы оттуда, либо восстановить(что в Вашем случае крайне нежелательно). Да и лечению подвержена крайне малая часть зараженных файлов,трояны же являются изначально вредоносными файлами, поэтому лечить в них нечего, только удалять.
2. При удалении антивируса карантин также удаляется, поэтому никуда ваши пойманные файлы не разбегутся. Тем более они помещаются в карантин в неактивном состоянии, т.е не могут принести вреда.