No soy experto en esto ni mucho menos como para darte una respuesta exacta de por que lo abre en el sandbox y otros archivos no.
Te ofrece abrir en el sandbox solo los archivos que considera sospechosos, talves tu portable accede a ciertos recursos clave de la máquina o realiza alguna acción como abrir puertos o escribir en algún área del registro, o lo que sea que puede ser usado en forma maliciosa.
Esto de ningún modo quiere decir que tu programa sea peligroso, es solo una medida de precaución.