こんばんは くま太郎 さん
セーフゾーンは隔離された環境で動作していますので、そこで保存したファイルは、基本的には同じように隔離されます。
隔離環境にあるファイルは隔離環境内(=セーフゾーン内)からは見えますが、隔離環境外(=通常のデスクトップ)では見えません。
一部のファイル(テキストファイルなど)は隔離されずに保存されますが、こちらで実験したところ、実行ファイルは隔離されたままのようです。
現時点では、隔離されたファイルを後から取り出す方法は無いに等しい(別OSから起動すれば不可能ではないですが…)ので、
ファイルについては再度ダウンロードしてもらうしかないかと思います。