こんにちは orso さん、返信が遅くなりました。
2016.11.1.2245 から、Eメールの署名設定は2か所に分離され、1つは設定 -> 一般 -> Enable avast E-mail signature に、もう1つはもともとのメールシールドの中にあります。
メールシールドの設定が探しにくいということで、よりアクセスしやすい設定画面に設定がコピーされたものですが、「一般」側の設定が優先されるようで、メールシールド側の設定が反映されないようです。
設定 -> 一般 -> Enable avast E-mail signature のチェックを外してみてください。